目前设有“食品科学与工程”一级学科硕士点（下设“食品科学”、“粮食、油脂以及植物蛋白工程”、“农产品加工及贮藏工程”、“水产品加工及贮藏工程”四个二级学科）和“食品加工与安全”专业学位硕士点。
食品科学（专业代码：083201）
主要研究方向：
1.食品营养与健康
2.食品质量与安全
3.食品资源开发与利用
粮食、油脂以及植物蛋白工程（专业代码：083202）
主要研究方向：
1、粮油产品加工、贮藏及安全控制
2、植物蛋白质结构与功能及其修饰
3、植物多糖结构与功能及其修饰
4、保健食品功能因子开发
农产品加工及贮藏工程（专业代码：083203）
主要研究方向：
1. 果蔬贮藏与加工
2. 肉品加工与质量安全控制
水产品加工及贮藏工程（专业代码：083204）
主要研究方向：
1. 水产品加工与保鲜
2. 水产品质量与安全控制
3. 水产品营养与功能
食品加工与安全（095135）
主要研究方向：
1. 食品质量与安全
2. 水产品加工与安全
3. 肉品加工与安全
4. 果蔬加工与安全
5. 粮油食品加工与安全